Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms