Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LPIN3Q9BQK8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms