Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms