Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDCA3Q99618 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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