Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3R4Q99570 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3R4Q99570 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.9 ms