Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGMNQ99538 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms