Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC22A12Q96S37 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms