Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ULK4Q96C45 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ULK4Q96C45 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms