Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC112Q8NEF3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC112Q8NEF3 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms