Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4T4

ARHGEF39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF39Q8N4T4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ARHGEF39Q8N4T4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ARHGEF39Q8N4T4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ARHGEF39Q8N4T4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ARHGEF39Q8N4T4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ARHGEF39Q8N4T4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ARHGEF39Q8N4T4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ARHGEF39Q8N4T4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ARHGEF39Q8N4T4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ARHGEF39Q8N4T4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARHGEF39Q8N4T4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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