Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms