Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHA9Q7RTU4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms