Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSSK4Q6SA08 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms