Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP170Q5SW79 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms