Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C3orf38Q5JPI3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C3orf38Q5JPI3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C3orf38Q5JPI3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C3orf38Q5JPI3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C3orf38Q5JPI3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C3orf38Q5JPI3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C3orf38Q5JPI3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C3orf38Q5JPI3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C3orf38Q5JPI3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms