Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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