Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC27Q2M243 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms