Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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