Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NRF1Q16656 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms