Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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ECM1Q16610 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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