Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ZNF239Q16600 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
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