Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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