Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ZNF56Q15929 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms