Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
USF2Q15853 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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