Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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IRF4Q15306 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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IRF4Q15306 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF4Q15306 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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