Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms