Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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DDX39BQ13838 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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DDX39BQ13838 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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DDX39BQ13838 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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DDX39BQ13838 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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DDX39BQ13838 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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DDX39BQ13838 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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DDX39BQ13838 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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DDX39BQ13838 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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DDX39BQ13838 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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DDX39BQ13838 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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DDX39BQ13838 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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DDX39BQ13838 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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