Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BFSP2Q13515 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BFSP2Q13515 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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