Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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