Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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