Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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FOXF1Q12946 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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FOXF1Q12946 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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FOXF1Q12946 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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FOXF1Q12946 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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FOXF1Q12946 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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FOXF1Q12946 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
FOXF1Q12946 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF1Q12946 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF1Q12946 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF1Q12946 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF1Q12946 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF1Q12946 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF1Q12946 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF1Q12946 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF1Q12946 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF1Q12946 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FOXF1Q12946 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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