Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTPRJQ12913 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTPRJQ12913 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTPRJQ12913 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTPRJQ12913 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTPRJQ12913 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTPRJQ12913 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTPRJQ12913 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTPRJQ12913 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTPRJQ12913 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PTPRJQ12913 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PTPRJQ12913 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PTPRJQ12913 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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