Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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