Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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CDH17Q12864 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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