Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms