Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOX4Q06945 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms