Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BNC1Q01954 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms