Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms