Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms