Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKOR1P84550 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms