Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX1P78414 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX1P78414 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX1P78414 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms