Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX1P78337 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX1P78337 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms