Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms