Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA2D1P54289 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms