Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPAP53621 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COPAP53621 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms