Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms