Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTAP49354 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNTAP49354 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms