Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms