Protein–RNA interactions for Protein: P41162

ETV3, ETS translocation variant 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV3P41162 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV3P41162 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV3P41162 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV3P41162 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV3P41162 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ETV3P41162 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ETV3P41162 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV3P41162 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms