Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GGCXP38435 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GGCXP38435 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GGCXP38435 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GGCXP38435 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GGCXP38435 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GGCXP38435 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GGCXP38435 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GGCXP38435 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GGCXP38435 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GGCXP38435 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GGCXP38435 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms